Indivíduos com alguns defeitos imunológicos conhecidos em anticorpos ou componentes imunológicos associados são particularmente suscetíveis à infecção por certos patógenos, o que pode fornecer informações sobre as características dos anticorpos necessários para a proteção contra aquele patógeno específico. Por exemplo, indivíduos com deficiências no sistema do complemento são particularmente suscetíveis à doença meningocócica causada pela infecção por Neisseria meningitidis porque o controle dessa infecção depende da morte de bactérias mediada pelo complemento, por meio da qual o complemento é direcionado à superfície bacteriana por anticorpos IgG.
A doença pneumocócica é particularmente comum em indivíduos com função esplênica reduzida (que pode ser congênita, resultante de trauma ou associada a condições como a anemia falciforme); bactérias S. pneumoniae que foram opsonizadas com anticorpo e complemento são normalmente removidas do sangue por fagócitos no baço, que não estão mais presentes em indivíduos com hipoesplenismo. Indivíduos com deficiência de anticorpos são suscetíveis ao vírus varicela-zóster (que causa catapora) e outras infecções virais, mas, uma vez infectados, podem controlar a doença da mesma forma que um indivíduo imunocompetente, desde que tenham uma resposta normal das células T .